Analyse der spezifischen Interaktion des feAPOBEC3Z3 mit FIVVif

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Den Lentiviren ist es gelungen ein Mittel (vif) gegen die antivirale Aktivität der APOBEC3 zu entwickeln, um sie somit zu neutralisieren. Indem sie u.a. eine durch Interaktion induzierte Polyubiquitinylierung verursachen, um dadurch die Degradation der APOBEC3 über das Proteasom einzuleiten. In diesem Buch wurden aus dem feAPOBEC3Z2 und huAPOBEC3 hapII zehn Chimäre erstellt. Mittels dieser Chimäre sollte die spezifische Interaktionsdomäne des feA3Z3 mit dem FIVVif ermittelt werden. Es wurden mehrere APOBEC3 auf ihre Proteinexpression, sowie ihrer antiviralen Aktivität gegenüber einem SIV-System hin überprüft. Zusätzlich wurde ermittelt welche der Test-APOBEC3 von FIVVif und HIVVif neutralisiert wurden. Das feAPOBEC3Z3 und huAPOBEC3 hapII hatten gute Voraussetzungen um sie als parentale APOBEC3s für die späteren Chimäre zu verwenden. Durch Fusion-PCR wurden die Chimäre aus vorher definierten Fragmenten der parentalen APOBEC3 erstellt und letztendlich in pcDNA 3.1(+) kloniert. Diese Chimäre wurden auf ihre Proteinexpression hin getestet und die, welche ausreichend Protein exprimierten, wurden für den weiteren Verlauf der Experimente verwendet, um somit deren Aktivität gegenüber dem SIV-System und dem FIVVif zu testen. Mittels verschiedener Analyseverfahren sollte die Interaktionsdomäne des feA3Z3 aus den Chimäre selektiert und bestätigt werden